
Contagion du coronavirus (Covid-19) : mutations, durée de contagiosité
Les variants du SARS-CoV-2 peuvent modifier la durée et l’intensité de la contagiosité. Le point sur ces mutations et la contagiosité du virus.
Article relu
14 min de lectureMis à jour le 27/06/26

Le coronavirus de type 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2), responsable de la maladie Covid-19, fait l’objet d’une surveillance épidémiologique continue en France.
Le conseil clé : Consultez votre médecin pour évaluer votre éligibilité à la dose de rappel automnal, notamment si vous avez plus de 65 ans ou une pathologie chronique.
Informations vérifiées en 2026 — Sources : HAS, Ameli.fr, ANSM, Assurance Maladie
L’épidémie de covid-19 continue de progresser sur le territoire français. Depuis le lancement de la vaccination et les nouvelles mesures gouvernementales, suivez l’évolution de l’épidémie avec l’équipe médicale de Qare, et faites le point sur les symptômes et les mesures de prévention pour éviter les contaminations.
Gorge, nez, toux : des symptômes qui s'installent ?
Un praticien peut évaluer vos symptômes en vidéo et vous prescrire un traitement si nécessaire.
D’après le dernier bilan de Santé Publique France :
À titre de comparaison, le bilan publié le 16 février 2022 par Santé Publique France faisait état de :
L’arrivée du variant Omicron à la fin du mois de décembre 2021 a entraîné une nouvelle vague épidémique. C’est une période de contamination très forte, mêlée à un début d’épidémie du virus monkeypox, il est préférable de rester chez vous en cas de symptômes, et de téléconsulter un médecin pour vous soigner.
Dans ce contexte, un certificat médical pour le covid peut être requis pour justifier une absence scolaire ou professionnelle en cas de symptômes avérés.
En France, depuis le début de l’épidémie :
En 2020, le pic de mortalité hebdomadaire sur le territoire atteignait des sommets. Le mois d’avril de cette année-là, par exemple, près de 3 800 personnes décédaient des suites du Covid-19 en une semaine (pic historique de la première vague). Le pic de la deuxième vague s’est également produit en période de confinement avec 1220 décès enregistrés en 24 heures le 10 novembre, et 1219 décès le 18 novembre.
Le vaccin de Pfizer-BioNTech (Comirnaty) est le premier vaccin contre le coronavirus à avoir été autorisé par l’Union Européenne, le 21 décembre 2020. La campagne de vaccination a pu commencer simultanément dans tous les pays membres dont la France, le 27 décembre 2020. Ce vaccin, utilisant la technologie ARN messager, a depuis été remplacé par des formulations adaptées successivement aux variants dominants (bivalents BA.4-5, XBB.1.5, JN.1, puis formulations monovalentes adaptées aux variants ultérieurs), conformément aux recommandations actualisées de la HAS et de l’EMA. La formulation initiale n’est plus utilisée à ce jour.
Par ailleurs, l’Agence Européenne du Médicament (EMA) a également donné son autorisation de mise sur le marché d’un autre vaccin à ARN messager, celui du laboratoire américain Moderna (Spikevax). Comme pour Pfizer, les formulations Moderna ont évolué vers des vaccins adaptés aux variants successifs, conformément aux recommandations actualisées de la HAS. À noter que la disponibilité du vaccin Moderna a été réduite sur le marché français depuis 2023.
En France, la campagne de vaccination a débuté le 27 décembre 2020, avec les résidents des EHPAD et le personnel soignant à risque et/ou de plus de 65 ans de ces établissements. Elle a commencé doucement avec quelques centaines de personnes vaccinées, et s’est considérablement accélérée depuis.
La vaccination contre la Covid-19 vise surtout à prévenir les formes graves. Une dose annuelle à l’automne est recommandée aux personnes de 65 ans et plus, aux femmes enceintes quel que soit le trimestre et aux personnes à risque, notamment dès 6 mois en cas de comorbidité. L’entourage des personnes vulnérables est également concerné. Les personnes hors de ces groupes peuvent en bénéficier si elles le souhaitent. La campagne d’automne 2026 commence le 13 octobre, avec des calendriers adaptés outre-mer. Le vaccin est pris en charge à 100 % ; l’injection suit les règles habituelles de remboursement.
À partir de 5 ans, la vaccination consiste généralement en une dose d’une formulation adaptée à l’âge. Le délai habituel depuis la dernière injection ou infection est de six mois, réduit à trois mois chez les personnes immunodéprimées ou âgées de 80 ans et plus. Pour les enfants de 6 mois à 4 ans jamais vaccinés et jamais infectés, le schéma initial comporte deux doses espacées de huit semaines. Les antécédents et situations particulières sont vérifiés avant la vaccination.
En Angleterre, une nouvelle souche plus contagieuse du virus de la covid-19 (SARS-Cov-2) a été découverte à la fin de l’année 2020. Le coronavirus a déjà connu plusieurs mutations depuis son apparition mais sans effet pour les humains.
À l’heure actuelle, la majorité des contaminations en France sont relatives au variant Omicron, découvert pour la première fois au début du mois de novembre 2021, au Botswana, puis en Afrique du Sud et à Hong Kong. Responsable de formes moins sévères de la maladie, ce variant n’en demeure pas moins beaucoup plus contagieux que son prédécesseur, le Delta (3 fois plus transmissible).
Les symptômes du Covid sont très variés et peuvent rappeler d’autres pathologies comme la grippe ou même un simple rhume. La liste des symptômes s’est donc allongée depuis le début de l’épidémie et un patient ne présente pas forcément tous les signes en même temps. La majorité des personnes infectées présentent des signes légers à modérés.
Il faut également rappeler que 20 à 40 % des personnes contaminées par le SARS-CoV-2 ne présentent aucun symptôme (cette proportion varie selon les variants et le statut vaccinal ; les estimations ont été revues à la hausse avec les variants Omicron) durant toute la durée de l’infection. On parle de personnes asymptomatiques ou de porteurs sains.
Nous avons listé les symptômes les plus fréquents en début d’infection, d’après une étude réalisée à Wuhan sur des patients ayant été hospitalisés :
La fièvre ou sensation fébrile est souvent le symptôme qui apparaît en premier. De manière générale, lorsque l’on est atteint par un virus il est très courant de ressentir une très grande fatigue liée à la fièvre.

Par ailleurs, la toux sèche caractéristique du Covid-19 diffère cliniquement de la toux spasmodique de la coqueluche, une infection bactérienne respiratoire très contagieuse.
La covid-19 peut également entraîner :
Si vous avez la covid-19, il est aussi possible d’avoir le nez qui coule et de le confondre avec d’autres maladies comme des rhinites ou des rhinopharyngites.
Bon à savoir : la déperdition de l’odorat ou du goût sont des symptômes bénins mais qui peuvent persister en cas de covid long. Ils sont néanmoins rarement associés à d’autres symptômes graves. L’asthénie prolongée est aussi un symptôme fréquent du covid long.
Lorsque la toux s’installe durablement, une toux persistante liée au covid doit être distinguée d’autres causes infectieuses pour orienter la prise en charge.
La gêne respiratoire (dyspnée) fait partie des premiers signes de gravité de l’infection à covid-19. Les douleurs dans la poitrine, mais aussi la perte de motricité ou difficulté d’élocution sont également des signes qui doivent alerter. Si vous ou l’un de vos proches présentez l’un de ces symptômes, vous devez immédiatement contacter les services d’urgences en contactant le SAMU au 15.
Les personnes à risque sont les personnes atteintes de maladies chroniques (diabète, hypertension, obésité morbide, bronchite chronique, maladies cardiaques, insuffisance rénale), les personnes dont le système immunitaire est affaibli ( le taux de lymphocytes baisse ) les personnes âgées notamment ainsi que les femmes enceintes. Ces personnes doivent être particulièrement protégées du virus.
Bon à savoir : le risque de forme grave de Covid-19 s’évalue individuellement, selon l’âge, les autres maladies, la sévérité de l’asthme et son contrôle. Un asthme sévère appelle une vigilance particulière, mais toute personne asthmatique n’est pas automatiquement à haut risque. Continuez votre traitement prescrit et demandez conseil à votre médecin en cas de Covid-19 ou d’aggravation respiratoire.
Si nous comptons à ce jour 2 confinements en France depuis le début de l’épidemie, ce n’est heureusement plus dans les projets du gouvernement d’en mettre en place un troisième, en majeure partie grâce à la vaccination.
Pour contrôler l’épidémie de covid-19 après le second confinement, le gouvernement a instauré un couvre-feu à 20h qui a ensuite été instauré à 18h, interdisant les déplacements après cette heure, sauf pour les personnes munies d’une attestation de déplacement. Cette période de couvre-feu a eu lieu du 17 octobre 2020 au 20 juin 2021.
Certains établissements comme les boîtes de nuits, les clubs et bars dansant ont du fermé leurs portes le 20 décembre 2021, pour réouvrir le 16 février 2022 sous réserve d’accueillir leur clientèle sur présentation du pass vaccinal et en recommandant le port du masque.
Par ailleurs, le port du masque n’est plus obligatoire dans les lieux publics clos et les transports depuis le 16 mai 2022. En entreprise, le télétravail n’est plus obligatoire mais recommandé depuis le 2 février 2022, et les gestes barrières doivent continuer d’être appliqués en présentiel.
Bon à savoir : ces mesures restrictives ont des effets psychologiques négatifs chez certaines personnes, comme le développement d’un stress chronique, des troubles du sommeil ou encore l’exacerbation de symptôme dépressif. Il est donc important de parler à un médecin de vos troubles si vous en ressentez le besoin.
Voir aussi : des psychiatres
Depuis le 1er février 2023, l’isolement n’est plus obligatoire après un test positif au Covid-19. Les personnes contacts n’ont pas non plus d’obligation de s’isoler. Pour limiter la transmission, évitez les contacts avec les personnes fragiles, portez un masque chirurgical ou FFP2, aérez et respectez l’hygiène des mains. Prévenez les personnes récemment rencontrées et surveillez votre état de santé. En cas de symptômes, demandez conseil à votre médecin, particulièrement si vous présentez un risque de forme grave.
Après un contact avec une personne positive au Covid-19, il n’y a pas d’obligation de s’isoler ni de calendrier universel de tests à J2, J4 ou J7. Surveillez l’apparition de symptômes, appliquez les gestes barrières, portez un masque et évitez les personnes fragiles. Un médecin peut apprécier l’utilité d’un test RT-PCR selon vos symptômes et votre situation. Un résultat négatif ne dispense pas de ces précautions.
Si vous avez des symptômes légers ou modérés de la covid-19, vous pouvez consulter un médecin en téléconsultation pour éviter tout risque de contamination.
Voici à quel moment il est recommandé de faire votre test PCR selon votre situation afin de faciliter le diagnostic.
Si vous ne pouvez pas effectuer de test virologique dans ces délais, cela réduit la fiabilité du résultat. Un test sérologique pourra éventuellement vous être prescrit en téléconsultation en diagnostic de rattrapage. Vous pouvez obtenir une ordonnance pour le test par téléconsultation.

Les gestes barrières et de distanciation sociale permettent de limiter le risque de contamination. Voici les conseils de prévention contre la covid-19 :
Les États-Unis sont le pays le plus durement touché par l’épidémie de covid-19. Entre le début de l’épidémie et février 2022, plus d’1 million de victimes ont été recensées dans le pays. On dénombre plus de 87 millions de cas depuis le début de l’épidémie. Les mesures de restrictions varient d’un état à l’autre.
Le vaccin produit par l’entreprise américaine Pfizer avec le laboratoire allemand BioNTech a été approuvé début décembre 2020 et une campagne de vaccination massive est toujours en cours. Pour le moment, plus de 67,5 % de la population est complètement vaccinée, soit 222 millions de personnes.
Suite à la découverte d’une souche plus contagieuse du coronavirus en Angleterre, le gouvernement avait annoncé un nouveau confinement début janvier 2021 qui s’est prolongé jusqu’en mars. L’épidémie a commencé à s’accélérer à cause du variant Delta. L’Angleterre aujourd’hui, compte plus de 181 000 décès à ce jour, ce qui en fait un des pays les plus touchés d’Europe. Elle ne fait plus l’objet de restriction sanitaires depuis le mois de janvier 2022.
Le Royaume-Uni a commencé sa campagne de vaccination en décembre 2020. Les chiffres de couverture de juillet 2022 sont des données historiques, non un état des lieux actuel. Les premières restrictions britanniques concernant les allergies ont évolué : une allergie alimentaire ou médicamenteuse ne constitue pas à elle seule une contre-indication aux vaccins contre la Covid-19. Une allergie à un composant ou une réaction grave après une dose nécessite une évaluation spécialisée.

L’Allemagne compte au 1er juillet 2022 plus de 141 000 décès dû à la covid-19. Face à la deuxième vague plus féroce de l’épidémie fin 2020, Angela Merkel et son gouvernement avaient annoncé des mesures plus restrictives. Les écoles, crèches et commerces non essentiels sont restés fermés jusqu’au 31 janvier 2021. La vaccination a également commencé le 27 décembre 2020, et tout comme en France, le gouvernement a dû essuyer des critiques sur la lenteur de la campagne. Aujourd’hui, environ 76,1% de la population allemande est vaccinée.
Avec plus de 168 000 décès, l’Italie est également un des pays qui a été les plus gravement touchés par le coronavirus. L’interdiction de se déplacer entre régions a été prolongée jusqu’au 15 février 2021. Aujourd’hui, on y compte plus de 47 millions de personnes complètement vaccinées.
En Espagne, des mesures plus restrictives au niveau local ont été mises en place face à la hausse du nombre de cas fin 2020. L’Espagne comptabilise plus de 108 000 décès depuis le début de l’épidémie. En revanche, plus de 40,6 millions de personnes sont complètement vaccinées à ce jour, soit 81,1% de la population.
Les symptômes du Covid peuvent ressembler à ceux d’autres infections respiratoires : fièvre, toux, mal de gorge, nez qui coule, fatigue, courbatures, maux de tête, perte de goût ou d’odorat, parfois troubles digestifs. Leur intensité varie beaucoup d’une personne à l’autre.
La circulation du Covid varie selon les périodes et les régions. Pour savoir si le virus circule actuellement, les indicateurs de Santé publique France, les bulletins respiratoires et les données de surveillance sont les sources les plus fiables.
Le traitement du Covid repose surtout sur le repos, l’hydratation et le soulagement des symptômes, par exemple avec du paracétamol en respectant les doses. Les personnes à risque de forme grave peuvent bénéficier d’une prise en charge spécifique selon leur situation.
La contagiosité est généralement plus forte autour du début des symptômes et dans les premiers jours. Elle peut durer environ une semaine, parfois plus selon l’état de santé, la sévérité des symptômes et l’immunité de la personne. Les gestes barrières restent utiles pendant cette période.
Nos articles citent des sources officielles : HAS, Ameli, études cliniques.
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