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PCR chlamydia : comment faire le test de dépistage ?

Femme discutant avec une professionnelle dans un cabinet gynécologique.

L’essentiel en 30 secondes

La PCR chlamydia (réaction en chaîne par polymérase) est le test de référence pour détecter Chlamydia trachomatis, la bactérie responsable de l’infection sexuellement transmissible (IST) bactérienne la plus fréquente en France.

  • Chez la femme, le prélèvement de référence est l’auto-prélèvement vaginal, préféré à l’urine ; chez l’homme, c’est le premier jet d’urine, ou le pus en cas d’écoulement. (HAS)
  • Le résultat est en général disponible en quelques jours, selon le laboratoire d’analyses médicales ; avec le kit à domicile, un SMS l’annonce environ 5 jours après l’envoi du prélèvement. (Ameli.fr)
  • Avec ou sans ordonnance, le test est pris en charge à 100 % avant 26 ans, sans avance de frais, et remboursé à 60 % à partir de 26 ans. (Ameli.fr)
  • En cas de résultat positif, le traitement de première intention est la doxycycline, 100 mg deux fois par jour pendant 7 jours ; l’azithromycine en dose unique est réservée aux contre-indications à la doxycycline et aux deux derniers trimestres de la grossesse. (HAS)
  • La HAS recommande un dépistage systématique chez toutes les femmes de 15 à 25 ans sexuellement actives, à refaire chaque année en cas de rapports non protégés avec un nouveau partenaire, et un dépistage ciblé en cas de facteurs de risque, chez les hommes quel que soit leur âge et chez les femmes de plus de 25 ans. (HAS)

Le conseil clé : faites une PCR chlamydia en cas de rapport non protégé ou de partenaire infecté, même sans symptômes : en laboratoire sans ordonnance, chez un médecin ou dans un CeGIDD (centre gratuit d’information, de dépistage et de diagnostic).

Informations vérifiées en octobre 2026 — Sources : HAS, Ameli.fr, Santé publique France

Le dépistage de la chlamydia recherche l’ADN de la bactérie dans un prélèvement (vaginal, de l’anus, de la gorge ou des urines) grâce à la technique PCR. L’équipe médicale de Qare vous explique comment faire ce test, avec ou sans ordonnance, et dans quels cas il est recommandé.

Un doute après un rapport à risque ?

Un praticien peut vous orienter en vidéo vers le dépistage adapté et répondre à vos questions, en toute confidentialité.

Comment faire un test PCR pour la chlamydia ?

Le dépistage de la chlamydia par PCR peut se faire en laboratoire d’analyses médicales, chez un médecin, une sage-femme ou un gynécologue, ou dans un centre gratuit de dépistage des IST (CeGIDD). Depuis le 1er septembre 2024, tout laboratoire peut le faire sans ordonnance ni rendez-vous, quel que soit votre âge, comme ceux de la syphilis, de la gonorrhée, de l’hépatite B et du VIH : c’est le dispositif Mon test IST. Le test de la chlamydia est pris en charge à 100 % avant 26 ans, sans avance de frais, et remboursé à 60 % à partir de 26 ans.

Vous pouvez aussi demander une ordonnance, par exemple en téléconsultation : le remboursement est le même avec ou sans ordonnance, mais le médecin vous aide à choisir les prélèvements et les autres IST à rechercher.

Bon à savoir : il n’est pas nécessaire d’être à jeun pour un test PCR de la chlamydia. Si le test est positif, découvrez notre article sur l’antibiotique adapté contre la chlamydia.

Quel test faire pour la chlamydia ?

Le test PCR recherche l’ADN de la bactérie Chlamydia trachomatis. La même analyse recherche en général aussi le gonocoque ; Mycoplasma genitalium n’est en général recherché qu’en cas de symptômes. Le prélèvement dépend du sexe et des pratiques sexuelles :

  • Chez les femmes : le prélèvement de référence est un auto-prélèvement vaginal, fait avec un écouvillon, ou un prélèvement vaginal fait par un soignant. Il est préféré à l’analyse d’urine.
  • Chez les hommes : le test se fait sur le premier jet d’urine. En cas d’écoulement par le pénis, le pus peut aussi être prélevé.

Chez les hommes comme chez les femmes, un prélèvement de l’anus ou de la gorge s’y ajoute selon les pratiques sexuelles.

Dépistage de la chlamydia : où faire un test PCR ?

Pour un dépistage entièrement gratuit, et anonyme si vous le souhaitez, vous pouvez vous rendre dans un CeGIDD (centre gratuit d’information, de dépistage et de diagnostic), quel que soit votre âge. Vous pouvez aussi consulter votre médecin généraliste, une sage-femme ou un gynécologue. Le prélèvement peut être fait au cabinet ou en laboratoire.

L’auto-prélèvement est possible : chez la femme, vous faites vous-même le prélèvement vaginal, préféré à l’analyse d’urine, au laboratoire ou au cabinet. Entre 18 et 25 ans, vous pouvez aussi commander sur mon-test-ist.ameli.fr un kit d’auto-prélèvement à faire chez vous, pris en charge à 100 % : les femmes depuis le 1er juillet 2025, les hommes et les personnes trans ou non binaires depuis le 29 mai 2026. Le prélèvement est renvoyé au laboratoire, et un SMS annonce environ 5 jours plus tard que les résultats sont consultables en ligne.

Une patiente échange en vidéo avec une médecin sur une tablette, en téléconsultation.

Comment faire pour savoir si on a la chlamydia ?

Faire un test de dépistage PCR est le seul moyen de savoir si vous avez la chlamydia. L’examen clinique ne suffit pas, car l’infection est souvent silencieuse : la présence de symptômes n’est pas la règle. Selon l’Assurance Maladie, près d’une personne infectée sur deux, homme ou femme, n’a aucun symptôme. Avec ou sans symptômes, l’infection est contagieuse.

Les symptômes de la chlamydia peuvent inclure :

  • des pertes vaginales inhabituelles ;
  • des saignements vaginaux entre les règles ou après les rapports sexuels ;
  • un écoulement par le pénis ou par l’anus ;
  • des douleurs et des brûlures en urinant ;
  • des douleurs au bas du ventre, aux testicules ou au rectum.

Quelle est la fiabilité du test PCR de la chlamydia ?

Le test PCR est l’examen de référence : il est très performant, à condition d’être fait sur le bon prélèvement. Un résultat négatif ne vaut que pour les zones prélevées : selon vos pratiques, un prélèvement de la gorge ou de l’anus peut être nécessaire. Et un test fait très tôt après l’exposition peut être faussement rassurant : un second test peut alors être proposé.

Une femme en chemise blanche et en jean pose les mains sur son bas-ventre, gênée par une douleur.

Quel est le délai du résultat de la PCR pour la chlamydia ?

Selon le laboratoire, les résultats sont en général disponibles en quelques jours. Il n’existe pas de délai officiel unique entre un rapport à risque et le test : selon Santé publique France, on peut se faire dépister entre 2 jours et 3 semaines après l’exposition, selon l’infection. Si le premier test a été fait très tôt, un second test peut être proposé. En cas de symptômes, ou si un partenaire vous annonce une chlamydia, consultez sans attendre, même si vous n’avez pas eu de rapport complet. Découvrez notre article sur le traitement complet de la chlamydia.

Questions fréquentes

Est-ce que l’infection à chlamydia est grave ?

La chlamydia passe souvent inaperçue, mais elle peut avoir des conséquences importantes, en particulier chez les femmes : non traitée, elle peut remonter vers les trompes de Fallope, les abîmer ou les boucher, et entraîner une infertilité ou une grossesse extra-utérine. Dépistée et traitée à temps, elle guérit sans séquelles.

Qu’est-ce qu’une PCR pour la chlamydia ?

La PCR est une technique de laboratoire qui recherche le matériel génétique d’un microbe dans un échantillon. Elle sert pour de nombreuses maladies, comme la covid-19. Pour la chlamydia, elle se fait sur un prélèvement vaginal, de l’anus ou de la gorge, ou sur le premier jet d’urine. Une prise de sang ne sert pas à dépister la chlamydia.

  • Sources médicales

    Nos articles citent des sources officielles : HAS, Ameli, études cliniques.

  • Téléconsultation

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